Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ttc29Q80VM3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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