Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Ccdc18Q640L5 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc18Q640L5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms