Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Usp10-202ENSMUST00000108988 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42633-201ENSMUST00000198853 2764 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gtf3c3Q3TMP1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms