Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 1700083H02Rik-201ENSMUST00000190526 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Pdlim5-209ENSMUST00000196908 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 AL672010.1-201ENSMUST00000215182 1246 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Olfr73-201ENSMUST00000099838 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms