Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms