Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa8P50706 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa8P50706 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms