Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
FmodP50608 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
FmodP50608 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
FmodP50608 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms