Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.5 ms