Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
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