Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Srp72F8VQC1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms