Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cfap46E9Q2C0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms