Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3298E9PW80 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3298E9PW80 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3298E9PW80 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3298E9PW80 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3298E9PW80 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3298E9PW80 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3298E9PW80 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3298E9PW80 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3298E9PW80 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3298E9PW80 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3298E9PW80 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms