Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zbed5B2RPU8 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms