Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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