Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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