Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Card11Q8CIS0 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms