Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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Ercc8Q8CFD5 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
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Ercc8Q8CFD5 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Ercc8Q8CFD5 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Ercc8Q8CFD5 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Ercc8Q8CFD5 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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