Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Usp27Q8CEG8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Usp27Q8CEG8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Usp27Q8CEG8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Usp27Q8CEG8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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