Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Clec18aQ7TSQ1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Clec18aQ7TSQ1 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Clec18aQ7TSQ1 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Clec18aQ7TSQ1 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Clec18aQ7TSQ1 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Clec18aQ7TSQ1 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Clec18aQ7TSQ1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Clec18aQ7TSQ1 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Clec18aQ7TSQ1 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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