Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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