Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ctdnep1Q3TP92 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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