Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms