Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Samd11Q1RNF8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms