Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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NfiaQ02780 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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NfiaQ02780 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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NfiaQ02780 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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NfiaQ02780 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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NfiaQ02780 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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NfiaQ02780 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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NfiaQ02780 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms