Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms