Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Cdh18-203ENSMUST00000164787 2744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Zfp58-201ENSMUST00000076123 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Dnmt3b-207ENSMUST00000109771 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Nedd4l-201ENSMUST00000080418 3326 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gsdme-203ENSMUST00000165099 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Rpp14-201ENSMUST00000023924 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 AC117245.4-202ENSMUST00000214403 3816 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Eif4e2-201ENSMUST00000050876 2869 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ddhd2-201ENSMUST00000033975 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irx2P81066 C78197-201ENSMUST00000152781 3417 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Tulp2-209ENSMUST00000210813 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Best3-201ENSMUST00000020378 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Irx2P81066 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms