Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Otx2P80206 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Otx2P80206 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms