Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cxcr4P70658 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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