Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbdsP70122 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbdsP70122 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbdsP70122 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbdsP70122 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbdsP70122 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbdsP70122 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbdsP70122 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SbdsP70122 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SbdsP70122 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbdsP70122 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbdsP70122 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbdsP70122 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SbdsP70122 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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