Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms