Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NapbP28663 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NapbP28663 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NapbP28663 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NapbP28663 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NapbP28663 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NapbP28663 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NapbP28663 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NapbP28663 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NapbP28663 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NapbP28663 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NapbP28663 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms