Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
P18524 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P18524 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P18524 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P18524 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P18524 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
P18524 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P18524 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18524 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P18524 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms