Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa-rs1P17533 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms