Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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