Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBP5

Cmpk1, UMP-CMP kinase, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmpk1Q9DBP5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cmpk1Q9DBP5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cmpk1Q9DBP5 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cmpk1Q9DBP5 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cmpk1Q9DBP5 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cmpk1Q9DBP5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cmpk1Q9DBP5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cmpk1Q9DBP5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cmpk1Q9DBP5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cmpk1Q9DBP5 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cmpk1Q9DBP5 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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