Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lims1Q99JW4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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