Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rnf144aQ925F3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rnf144aQ925F3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rnf144aQ925F3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rnf144aQ925F3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf144aQ925F3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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