Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samd4aQ8CBY1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms