Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Atg16l1Q8C0J2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Atg16l1Q8C0J2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Atg16l1Q8C0J2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Atg16l1Q8C0J2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Atg16l1Q8C0J2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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