Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim35Q8C006 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trim35Q8C006 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trim35Q8C006 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trim35Q8C006 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trim35Q8C006 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim35Q8C006 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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