Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms