Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms