Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Disp1-202ENSMUST00000171366 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Defa20Q45VN2 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Defa20Q45VN2 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Defa20Q45VN2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Defa20Q45VN2 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Defa20Q45VN2 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Defa20Q45VN2 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms