Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5460Q3UQ97 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms