Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms