Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms