Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms