Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psme1P97371 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psme1P97371 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psme1P97371 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psme1P97371 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psme1P97371 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psme1P97371 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psme1P97371 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psme1P97371 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psme1P97371 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psme1P97371 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psme1P97371 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms