Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2iP60898 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.2 ms