Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Zfp672-203ENSMUST00000065533 2619 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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